La segunda etapa el CJM estuvo abocada a la restitución de los bienes de los judíos, que habían sido confiscados durante la Guerra y a las compensaciones. De este modo, el CJM participó de la creación de la Claims Conference (Conferencia por el Reclamo del Material Judío contra Alemania) y de los reclamos a los bancos suizos, donde obtuvo increíbles éxitos.

Durante la tercera etapa, el CJM -y todas sus ramas regionales- están abocadas al resguardo de la memoria del Holocausto y a combatir la negación del mismo, convencidos de que solo las acciones vinculadas a la educación, recordación e investigación de este capítulo negro en la historia universal, evitaran futuros genocidios.

En esta línea, el Congreso Judío Latinoamericano denuncia todos los hechos de xenofobia y antisemitismo que se suceden a nivel regional, conciente de que la adopción de medidas concretas para prevenirlo y condenarlo es la única vía para erradicar a este germen que amenaza con instalarse en la sociedad latinoamericana.